SZPZLO Warszwa-Wawer zarządzany jest przez :
- Dyrektora : lek. med. Marię Aleksandr Kąkol;
i
- Zastępcę dyrektora ds. finansowo-księgowych : mgr ekonomii Anna Sychowska
Przy SZPZLO funkcjonuje Rada Społeczna SZPZLO jako organ doradczy i nadzorujący działalność statutową.